2021年9月11日，www.优德88.cpm 巴斯德学院吴小惠教授课题组在国际著名期刊《Nucleic Acids Research》发表题为“scAPAdb: a comprehensive database of alternative polyadenylation at single-cell resolution”的研究论文。

选择性多聚腺苷化(APA)是真核生物转录多样化的广泛调控机制，最新的单细胞RNA-seq (scRNA-seq)研究揭示了不同组织、生物过程和疾病中不同细胞类型的APA动态。吴小惠团队开发了scAPAdb数据库(http://www.bmibig.cn/scAPAdb/)，提供了单细胞水平全基因组poly(A)位点、APA事件和poly(A)信号图谱。scAPAdb从超过360个scRNA-seq实验中收集APA信息，涵盖包括人类、小鼠、水稻、拟南芥等六个物种，覆盖超过260种细胞类型的上百万个细胞。scAPAdb还提供数据批量下载，用户可以通过基因标识符、基因功能、索引号等多种关键词查询数据库。scAPAdb将为研究单细胞水平不同细胞类型、组织和物种APA动态变化以及APA介导的基因调控提供丰富资源。

该研究工作由www.优德88.cpm 巴斯德学院吴小惠课题组和厦门大学吉国力课题组合作完成，www.优德88.cpm 为论文第一单位，吴小惠教授为论文通讯作者，厦门大学博士生朱胜为论文第一作者，厦门大学博士生叶文斌、吴小惠教授的研究生练启威、秦威和吴哲也参与此工作。该研究得到了国家自然科学基金面上项目支持。

吴小惠课题组长期致力于生物和健康医疗大数据研究，特别是APA相关分析，该研究是继课题组发表的一系列APA分析工具或数据库，如PlantAPAdb、APAtrap、scAPAtrap、movAPA，之后的又一重要成果。

文章链接：

https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkab795/6368523?login=true