感染免疫是研究宿主和病原微生物相互作用的科学。病原体感染机体后，宿主免疫细胞迅速识别并通过固有免疫和适应性免疫做出免疫应答，抵抗病原体入侵；同时，病原体亦能进化出逃避免疫系统监控的逃逸机制，进而造成患者组织器官损伤。

IBMS基于江苏省感染与免疫重点实验室，专注重大感染性疾病病原体（柯萨奇病毒B3、乙肝病毒、结核分枝杆菌等）：

（1）研究宿主对病原体的免疫识别、应答、调控及其在疾病中的作用。

（2）探索病原体与宿主细胞相互作用的分子基础，提出病原体免疫逃逸机制及其干预策略。

（3）明晰炎性组织微环境重塑组织区域免疫并导致器官损伤的作用、机制和应对策略。