2024年4月22日,我院周芳芳教授科研团队在Cell在线发表题为“Alanyl-tRNA synthetase, AARS1, is a lactate sensor and lactyltransferase that lactylates p53 and contributes to tumorigenesis”的研究论文,这是我院首次以第一单位在Cell正刊上发表研究成果。该研究发现AARS1作为乳酸的感知蛋白介导肿瘤细胞中的全局赖氨酸乳酸化修饰。AARS1与乳酸结合并催化形成乳酸-AMP,随后乳酸基团转移到底物蛋白的赖氨酸残基,造成乳酸化修饰。
蛋白质修饰组学研究揭示了大量的AARS1靶点,包括p53,其中DNA结合域的K120和K139位赖氨酸被乳酸化。利用遗传密码扩展策略生成了特异位点乳酸化修饰的p53,p53乳酸化阻碍了其液-液相分离、DNA结合和转录激活。在携带野生型p53的癌症患者中,AARS1表达水平和p53乳酸化修饰水平与预后不良相关。在动物模型中,β-丙氨酸破坏乳酸与AARS1的结合,降低p53的乳酸化,并减轻肿瘤的发生。
代谢异常是癌症的标志。即使有氧气存在,大多数癌细胞也倾向于有氧糖酵解的代谢模式,被称为“Warburg效应”,这种代谢改变会导致糖酵解中间体(如乳酸)的升高,以促进细胞增殖。有证据表明,乳酸参与调节多种生物过程,如免疫细胞分化、肿瘤免疫监视、纤维化、缺血性损伤,并通过一种被称为乳酸化的表观遗传修饰调节基因表达。这表明乳酸可以共价修饰蛋白质,然而,细胞内乳酸被感知并传导为乳酸化的机制尚不清楚。
肿瘤抑制因子p53介导多种功能;作为一种转录因子,它通过激活许多控制DNA修复、细胞周期进程和应激下存活的靶标来保护细胞免受恶性转化。p53的活性在肿瘤发生过程中经常被抑制,超过一半的人类癌症含有p53突变,损害p53肿瘤抑制活性。p53的活性也受翻译后修饰的调控,如磷酸化、乙酰化和泛素化。对p53调控机制的研究可以帮助提高p53的活性,拓宽癌症患者的治疗策略。
该研究进行了CRISPR筛选,发现AARS1是细胞内乳酸感知蛋白,直接结合乳酸并催化全局赖氨酸乳酸化,包括p53。通过ATP依赖性乳酸-AMP的形成,AARS1将乳酸基团共价结合到赖氨酸残基,并介导全局赖氨酸乳酸化。该研究发现大肠杆菌AlaRS (EcAlaRS)也能催化全局蛋白质包括p53的乳酸化,这表明AARS1的乳酸转移酶活性是一种古老而保守的功能。AARS1介导其DNA结合域(DBD)的位点特异性p53乳酸化,阻止p53与含有p53应答元件(p53RE-DNA)的DNA结合,从而抑制p53液-液相分离(LLPS)和转录。这项工作还提供了一种利用β-丙氨酸阻止p53乳酸化的方法,β-丙氨酸与乳酸竞争结合AARS1,从而加强癌症化疗效果。总之,这些研究拓展了蛋白质乳酸化的认知,揭示了代谢物乳酸与肿瘤发生和发展之间的直接相互作用。